Metadati
Nella sezione "Elementi principali" del menù di navigazione laterale, è presente l'insieme delle funzionalità relative ai Metadati (link pagina Wikipedia).
I metadati in piattaforma sono suddivisi nelle seguenti categorie:
- Specie: elenco delle specie degli organismi, insieme ai corrispondenti codici identificativi. La categoria è a sua volta suddivisa in:
- Materiale patogeno: tipologia dell'origine del campione (coltura, materiale genetico o file di sequenza) con i codici identificativi corrispondenti.
- Punto Prelievo: elenco dei luoghi in cui è stato originariamente prelevato il campione (nomi di enti, aziende, ospedali e/o coordinate di latitudine e longitudine), insieme ai corrispondenti codici identificativi.
I metadati sono essenziali per il caricamento di un nuovo campione nella piattaforma. Si prega di consultare la sezione relativa all'Upload per maggiori dettagli.
I metadati possiedono alberi gerarchici, consultabili attraverso il menu contestuale presente a livello delle singole categorie.
Codifiche secondo standard EFSA
In piattaforma, per garantire uniformità di codifica agli utenti esterni, i metadati dei campioni aderiscono alle specifiche EFSA FOODEX2.
Specie patogeno
La tabella Specie patogeno elenca le specie di patogeni e i corrispondenti codici con cui esse vengono identificate nella piattaforma. Le operazioni disponibili sono le stesse della tabella dei campioni.
Specie ospite
La tabella Specie Host elenca le specie degli organismi ospite ed i codici corrispondenti. La lista di organismi "ospite" fa riferimento agli organismi i cui genomi reference siano stati aggiunti alla piattaforma. Le operazioni disponibili sono le stesse della tabella dei campioni.
Materiale patogeno
Nella tabella Materiale patogeno viene riporata la tipologia di origine del campione, sia che si tratti di coltura, materiale genetico o file di sequenza, insieme ai codici corrispondenti. Le operazioni disponibili sono le stesse della tabella dei campioni.
Punto prelievo
La tabella del Punto Prelievo elenca i codici delle località in cui è avvenuto il primo prelievo o recupero del materiale da cui è stato isolato un campione. Il "punto prelievo" comprende provincia, comune, eventuale indirizzo e struttura o ente. Le operazioni di base disponibili sulla tabella sono le stesse possibili su quella dei campioni ma, per alcuni profili autorizzati, è possibile aggiungere punti prelievo da sorgenti esterne in autonomia che, una volta selezionati, entreranno a far parte dei punti prelievo della piattaforma.
Aggiungi punto prelievo
Le sorgenti esterne alla piattaforma attualmente disponibili sono:
- Aziende registrate in Banca Dati Nazionale (BDN);
- Stabilimenti Italiani riconosciuti o registrati.
Per effettuare la ricerca in entrambe le sorgenti esterne, è necessario disporre di un codice (codice azienda per BDN e Approval Number per le altre strutture). Le funzioni di aggiunta del punto prelievo sono disponibili sia sulla pagina Punto Prelievo, sia in fase di preparazione e caricamento dei metadati. Di seguito, potete trovare alcuni video dimostrativi.