Controlli qualità dei taxa
La tabella Controlli qualità dei taxa fornisce informazioni relative alle possibili contaminazioni presenti nel campione, valutate attraverso specifiche analisi in silico.
Le colonne dei metadati, oltre a Codice e Descrizione che si riferiscono all'identificativo del risultato dell'analisi, sono:
- Risultato: codice del risultato (RIS_CD) al quale le statistiche si riferiscono;
- Campione Genpat: codice GENPAT_CD del campione;
- Coverage verticale delle read grezze: coverage verticale ipotetico delle read grezze;
- Coverage verticale delle read trimmate: coverage verticale ipotetico delle read trimmate;
- % di read non classificate: percentuale di read non assegnate ad alcun microorganismo;
- Numero di read non classificate: numero di read non assegnate ad alcun microorganismo;
- Prima specie assegnata: prima specie identificata (la più presente);
- Coverage verticale della prima specie assegnata: coverage verticale del genoma della prima specie assegnata (considerando le read trimmate);
- Numero di read assegnate alla prima specie: numero di read assegnate alla prima specie identificata;
- % di read assegnate alla prima specie: percentuale di read assegnate alla prima specie identificata;
- Seconda specie assegnata: seconda specie identificata;
- Numero di read assegnate alla seconda specie: numero di read assegnate alla seconda specie identificata;
- % di read assegnate alla seconda specie: percentuale di read assegnate alla seconda specie identificata;
- Terza specie assegnata: terza specie identificata;
- Numero di read assegnate alla terza specie: numero di read assegnate alla terza specie identificata;
- % di read assegnate alla terza specie: percentuale di read assegnate alla terza specie identificata;
- Primo genus assegnato: primo genus identificato;
- Numero di read assegnate al primo genus: numero di read assegnate al primo genus identificato;
- % di read assegnate al primo genus: percentuale di read assegnate al primo genus identificato;
- Secondo genus assegnato: secondo genus identificato;
- Numero di read assegnate al secondo genus: numero di read assegnate al secondo genus identificato;
- % di read assegnate al secondo genus: percentuale di read assegnate al secondo genus identificato;
- Terzo genus assegnato: terzo genus assegnato;
- Numero di read assegnate al terzo genus: numero di read assegnate al terzo genus identificato;
- % di read assegnate al terzo genus: percentuale di read assegnate al terzo genus identificato.