Pipeline OBITools
Introduzione
La pipeline OBITools esegue il software open source OBITools che consiste in un insieme di programmi progettati per l’analisi dei dati NGS, con un approccio di DNA metabarcoding.
OBITools available at: http://metabarcoding.org/obitools ObiTools official guide: https://pythonhosted.org/OBITools/welcome.html ObiTools GitHub page: https://github.com/metabarcoding/
Lancia la pipeline OBITools
Nel sistema di lancio analisi, è possibile usare il filtro in alto per visualizzare esclusivamente le pipelines. Una volta selezionata la pipeline OBITools nella pagina dedicata al lancio di analisi, il sistema passerà ad un'interfaccia di conferma.
OBITools accetta esclusivamente reads grezze da tecnologia Illumina *paired-end*. La pagina per la definizione dei parametri permette di modificare tutti gli argomenti del software OBITools. Per una guida dettagliata sull'argomento, si invita a consultare le risorse ufficiali del software: https://pythonhosted.org/OBITools/welcome.html.
Una volta lanciata la pipeline, la pagina genererà un link alla sezione Controllo analisi, per permettere di visualizzare lo stato del processo. L'utente verrà notificato dal sistema sia una volta lanciata con successo la pipeline, sia al termine dell'esecuzione.