Controlli qualità di Kleborate
La tabella dei Controlli qualità Kleborate riporta i risultati della pipeline Kleborate per lo screening di Klebsiella pneumoniae.
I dati sono organizzati per tipologia. Il numero di colonne è elevato, pertanto si consiglia di visualizzare i dati aggiuntivi aprendo la scheda dell'item di interesse o facendo uso della gestione delle colonne. Vi ricordiamo che l'apertura di un singolo item permetterà la visualizzazione di tutti i metadati disponibili.
- La tipologia Controllo qualità di specie comprende colonne come Specie e Match di specie che riportano, rispettivamente, la specie identificata da Kleborate e il grado di associazione;
- la tipologia Controllo qualità dell'assembly comprende le colonne dei dati di qualità riguardanti l'assemblaggio, come la Lunghezza totale, il Numero di contigs, il Contig più lungo ed N50 (vedi la pagina sul controllo qualità dell'assemblaggio);
- la tipologia MLST comprende colonne con informazioni derivanti dal Multi Locus Sequence Typing, come il Sequence Type (ST);
- la tipologia Resistenze comprende le colonne con i dati riguardanti i geni di resistenza del campione a vari composti;
- la tipologia Virulenze comprende le colonne con i dati riguardanti i geni di virulenza;
- la tipologia Dati di base contiene colonne con informazioni aggiuntive e dati riguardanti altri geni codificanti per proteine di interesse.