Topics
- Home
- Campioni ufficiali
- Elementi principali
- Filtra campioni
-
Analisi
- Lancia analisi
- Fasi e modalità di lancio
- Visualizza analisi
-
Descrizione tools
- Introduzione
- Tools per tecnologie non-Illumina
- Single sample
- Multi sample
-
Pipelines
- Mapping Virus Segmentati
- Covid Emergency
- Deplezione e de novo
- Draft del Genoma
- Enterotoxin S. aureus finder
- LSDV Complete
- Mapping Brucella
- Module AMR
- Nf-core ampliseq
- NgsManager
- Obitools
- Plasmids (AMR)
- Processamento Raw Reads
- Typing su Batteri
- WNV - Lineage Calculation and Mapping
- Filtering & de novo
- Plasmids AMR
- nf-core ampliseq
- Klebsiella (Kleborate)
- Modulo AMR
- QC fastqc
- QC Quast
- QC Nanoplot
- IAEA
- Report
- Download
- Upload
- Gestione Varianti
- Dashboards
- SOP
- Integrazioni SILAB
- Novità
- Supporto
Luglio 2024
Versione 24.07.1
In questo rilascio sono stati introdotti un nuovo strumento per le analisi, alcuni cambiamenti che riguardano l'esperienza utente insieme alla risoluzione di bug minori.
Pharokka
È stato aggiunto in Genpat il software Pharokka - annotation tool for bacteriophage genomes. Questo tool consente di ottenere l'annotazione del genoma specificamente per i batteriofagi. Ora è disponibile per l'analisi 4AN_genes (4AN_genes__pharokka).
Esperienza utente
Nella versione corrente sono state introdotte nuove funzioni che coinvolgono l'esperienza d'uso dell'applicativo. La prima riguarda una gestione più avanzata delle notifiche di errore, coprendo un range più ampio di casistiche per fornire messaggi più significativi sugli errori incontrati. Questa funzione include anche un controllo sui messaggi esistenti per evitare duplicazioni e un bottone per la chiusura massiva dei messaggi a schermo. La seconda ha a che fare con le notifiche e riguarda l'introduzione di un bottone che consente di ignorarle tutte.